罗斯山当中有被称为「时间之门」的时空扭曲存在。火箭队正计画借由「时间之门」穿越道过去的世界。他们打算大量捕捉过去已灭绝的神奇宝贝，借此增强战力征服合众地方！！为了让「时间之门」安定，需要「古代龟神奇宝贝」原盖海龟的生物能量…原盖海龟终于还是因为火箭队的化石复原装置，在现代世界复活了。困惑不已的原盖海龟，立刻逃走了。小智一行人找到它，带著它逃进森林，却再度遭到火箭队袭击！此时原盖海龟突然开始发光！？到底是怎么了！？
罗斯山当中有被称为「时间之门」的时空扭曲存在。火箭队正计画借由「时间之门」穿越道过去的世界。他们打算大量捕捉过去已灭绝的神奇宝贝，借此增强战力征服合众地方！！为了让「时间之门」安定，需要「古代龟神奇宝贝」原盖海龟的生物能量…原盖海龟终于还是因为火箭队的化石复原装置，在现代世界复活了。困惑不已的原盖海龟，立刻逃走了。小智一行人找到它，带著它逃进森林，却再度遭到火箭队袭击！此时原盖海龟突然开始发光！？到底是怎么了！？