小学5年级的男孩速杉隼人，按照跟爸爸的约定完成了假期作业，作为奖赏，要爸爸北斗带他去乘坐东北新干线“E5系隼号”。隼人对跟平时很忙碌的爸爸一起乘新干线万分期待。但是爸爸却接到了工作上的紧急电话不得不离开。隼人拿着爸爸落下的某张卡片来到铁道博物馆，误入地下的基地，看到在那里工作的爸爸，和一只正引发骚动的巨大怪物体。没有合适驾驶员致机器人无法出动的情况下，他们发现隼人持有极高的适合率。迫于紧急情况，北斗指导隼人驾驶“新干线战士 E5隼号”出击……
小学5年级的男孩速杉隼人，按照跟爸爸的约定完成了假期作业，作为奖赏，要爸爸北斗带他去乘坐东北新干线“E5系隼号”。隼人对跟平时很忙碌的爸爸一起乘新干线万分期待。但是爸爸却接到了工作上的紧急电话不得不离开。隼人拿着爸爸落下的某张卡片来到铁道博物馆，误入地下的基地，看到在那里工作的爸爸，和一只正引发骚动的巨大怪物体。没有合适驾驶员致机器人无法出动的情况下，他们发现隼人持有极高的适合率。迫于紧急情况，北斗指导隼人驾驶“新干线战士 E5隼号”出击……