1910年代……由大日本帝国陆军设立的学校——陆军栖凤中学。那里是一个为了获取可用于军事的力量，而收集、研究各地超常现象的特殊机构。栖凤中学三年级的岩元胡堂根据军方的训令，前往各地进行调查。此次岩元前往的，是一个飘落着“黑雪”的村庄。在那里，岩元遇见了一位生活在宛如地下牢房般的石墙中的、显得十分脆弱的少年。这与能够消除痛苦记忆的神秘超常现象之间，究竟有何关联……！？
1910年代……由大日本帝国陆军设立的学校——陆军栖凤中学。那里是一个为了获取可用于军事的力量，而收集、研究各地超常现象的特殊机构。栖凤中学三年级的岩元胡堂根据军方的训令，前往各地进行调查。此次岩元前往的，是一个飘落着“黑雪”的村庄。在那里，岩元遇见了一位生活在宛如地下牢房般的石墙中的、显得十分脆弱的少年。这与能够消除痛苦记忆的神秘超常现象之间，究竟有何关联……！？